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2024/2/19 转录因子分析软件Pyscenic常用于分析单个细胞群受到的转录因子调控,目前版本为0.12.1,在使用Pyscenic 进行分析的时候报错:AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'object'.为numpy软件不兼容所致。

AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'object'.[BUG] · Issue #474 · aertslab/pySCENIC · GitHub

综合GITHUB上的解决方案,依旧存在问题。

解决方案如下:

python = 3.8.1

Pyscenic = 0.12.1

numpy=1.19.5

pandas=1.3.5

numba = 0.56.4

按照上述软件安装即可

近期请国内外头部出版社可尽快私信博主!——心比天高,仗剑走天涯,保持热爱,奔赴向梦想!低调,谦虚,自律,反思,成长,还算是比较正能量的博主,公益免费传播……内心特别想在AI界做出一些可以推进历史进程影响力的东西(兴趣使然,有点小情怀,也有点使命感呀)… 12-17
File “ numpy /init.py”, line 305, in getattr AttributeError : module numpy ’ has no attribute object ’. was a deprecated alias for the builtin . To avoid this error in existing code, use by itself. Doing this will not modify any behavior and is safe. The al
performance profiling 自问自答十道题(问题来源:Brendan Gregg: System Performance Enterprise and Cloud book)