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Notebook 广场 发现「生物信息学 Notebooks Collection」🤗

边学边练,无需配置环境,仅需要专注于学习本身。依靠 免费的 2 核 4G 计算资源 ,你可以在平台上直接运行和修改代码。直接轻松上手生物信息学!

生物信息学

随着生物科技的飞速发展,生物信息学这一跨学科领域逐渐崭露头角。生物信息学是一门致力于研究生物数据的科学,涵盖了基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多个领域。

通过生物信息学的方法,我们可以深入挖掘生物数据背后的规律,为疾病诊断、新药研发、生态保护等领域提供有力支持。


Notebooks Collection

然而,生物信息学的学习与实践过程中,人们往往会遇到一些困难:

  • 初学者很难找到一个系统地能边学边练的平台;
  • 常用者在处理版本冲突、快速跑通特定方法时,缺乏一个高效的平台;
  • 论文发表者无法方便地将论文和代码环境打包在一起进行传播。

为了解决这些问题,我们推出了 生物信息学 Notebooks 系列 —— 对于生物信息学人来说,你可以方便的使用在线 Notebook 涵盖从学习、使用到传播的全过程。我们将在 Notebook 案例广场 整理一系列的生物信息学教程,让你轻松掌握生物信息学的精髓,成为实实在在的达人!


「单细胞转录组分析」案例

今天,作为这个系列的第一步,我们要向大家推荐一个单细胞转录组的 Notebook: 《一篇Notebook带你走进单细胞转录组分析》 ,这个案例的内容包括以下三个部分:

  1. 寻找状态转变过程中的基因聚类:通过对单细胞转录组数据进行聚类分析,一窥不同状态转变过程中的基因表达奥秘。
  2. 寻找聚类中的标记基因:找到这些聚类中的标记基因,让我们更加深入地了解细胞之间的关系及其功能变化。
  3. 拟时序计算:通过拟时序计算,我们可以对单细胞转录组数据进行时间序列分析,进而揭示细胞状态变化的动态过程。

这三个部分共同构成了一个完整的单细胞分析流程,点击下方 Notebook 链接,立即了解单细胞转录组分析: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1291

目前的单细胞系列Notebooks:

  1. 一篇Notebook带你走进单细胞转录组分析: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1291
  2. 单细胞转录组分析方法之数学原理初览: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1295
  3. 单细胞转录组分析方法实战之Shalek2013: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1296
  4. 单细胞转录组分析实战之Macaulay2016: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1297
  5. 细胞动力学模型探索之Cellbox: https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1298

未来,我们将推出更多的单细胞系列 Notebooks,以及“基础生信系列教程”、“空间组学系列教程”、“作图系列教程”等。我们相信这个系列将成为你在生物信息学道路上的得力助手!


欢迎关注我们的微信公众号 NBHub ,获取更多有趣的 Notebook 实践~

感兴趣的童鞋可以 查看原文加入生物信息学讨论群 https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5NTk3Nzk3MQ==&mid=2247484...

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