DeepWalk: Online Learning of Social Representations论文作者:B. Perozzi, R. Al-Rfou, and S. Skiena论文来源:KDD, 2014论文链接:https://arxiv.org/abs/1403.6652github链接:https://github.com/phanein/deepwalk文章目录前言一、Word2vec1.Skip-gram2.CBOW二、DeepWalk三、代码演示总结前言这是一篇图表
1.为什么出现
图
神经网络
GNN
?
近年来,人们对深度
学习
方法在
图
上的扩展越来越感兴趣。在多方因素的成功推动下,研究人员借鉴了卷积网络、循环网络和深度自动编码器的思想,定义和设计了用于处理
图
数据的
神经网络
结构:
图
神经网络
(Graph
Ne
ural
Ne
tworks,
GNN
)
传统的深度
学习
方法在提取欧氏空间数据(如Image) 的特征方面取得了巨大的成功,但在处理非欧式空间数据(如Graph) 上的表现却仍难以使人满意。许多实际应用场景中的数据是从非欧式空间生成的,如推荐系统中的
图
。
图
是不规则的,每
近年来,深度
学习
领域关于
图
神经网络
(Graph
Ne
ural
Ne
tworks,
GNN
)的研究热情日益高涨,
图
神经网络
已经成为各大深度
学习
顶会的研究热点。
GNN
处理非结构化数据时的出色能力使其在网络数据分析、推荐系统、物理建模、自然语言处理和
图
上的组合优化问题方面都取得了新的突破。
图
神经网络
有很多比较好的综述[1][2][3]可以参考,更多的论文可以参考清华大学整理的
GNN
paper list[4] 。
本篇文章将从一个更直观的角度对当前经典流行的
GNN
网络,包括GCN、GraphSAGE、GAT、GA
这几年
图
神经网络
模型(如谱聚类的GCN、GAT等等)都挺火的,这些
图
神经网络
即将节点或
图
映射到一个低维空间(称为
图
嵌入);而除了
GNN
还有很多
图
嵌入方法(在
GNN
之前
图
嵌入的概念常出现在流行
学习
和网络分析的研究中),这类
图
嵌入方法可以分为【基于矩阵分解的
图
嵌入方法】和【基于随机游走的
图
嵌入方法】,后者方法就是来自本篇论文,即第一个将NLP的思想用在网络嵌入(
Ne
tworking Embedding,
NE
)的。
论文:《
Deep
Walk
:
Onli
ne
L
ear
ning
of
Social
Repr
Perozzi B, Alrfou R, Skiena S.
Deep
Walk
:
onli
ne
l
ear
ning
of
social
repre
sentat
ion
s[J]. 2014:701-710.
Deep
Walk
源码
《
Deep
Walk
:
Onli
ne
L
ear
ning
of
Social
Repre
sentat
ion
s》笔记
C实现的
Deep
Walk
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Social
Repre
sentat
ion
s
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Walk
:
Onli
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L
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ning
of
Social
Repre
sentat
ion
sAbstractIntroduct
ion
Problem Definit
ion
L
ear
ning
Social
Repre
sentat
ion
sMethod实验设置Related Work我的看法参考资料
Abstract
Deep
Walk
概括了语言模型和无监督特征
学习
(或深度
学习
)
摘要当前,在线上有许多工具可用于T细胞表位预测。 他们通常专注于肽与抗原呈递细胞(APC)表面上的主要组织相容性复合体(MHC)分子的结合。 但是,肽和MHC复合物与T细胞受体(TCR)的结合对于免疫过程也很关键。 鉴定人表位与TCR的结合将对开发疫苗有用。 它还在诸如癌症和自身免疫性疾病等医学问题上具有广阔的前景。 我们提出了一种基于相似性的基于相似性的TCR表位预测方法。 本文介绍了
Deep
walk
方法,用于计算TCR-TCR之间的拓扑相似性,构建TCR相似性网络拓扑,并基于已知的TCR-表位关联预测TCR与表位之间的相关性。 我们从VDJDB数据库和经过训练的模型中从22种表位中选择数据,以实现TCR表位预测。 我们根据来自22种类型的表位的数据训练了一个模型,预测每个TCR属于哪个表位。 为了与其他方法进行比较,我们还生成了第二种方法,该方法包括为每种类型的表位训练模型,以便我们可以从大量的TCR中预测哪个TCR与表位结合。 我们使用ROC曲线,PR曲线和其他评估指标对我们的模型进行10倍交叉验证。 在第一个模型中,我们方法的AUC值为0.926,支持向量机(SVM)方法的AU
文献:
Deep
Walk
:
onli
ne
l
ear
ning
of
social
repre
sentat
ion
s
对比阅读了几篇关于网络
表示
学习
的文献,其中一篇包括
Deep
Walk
的提出,下面将自己对于论文的理解和论文的笔记组织好记录下来。
deep
walk
的提出是针对网络
表示
学习
的稀疏性提出来的,网络
表示
学习
的稀疏性问题对于统计
学习
任务有一定难度。
deep
walk
学习
的是
图
中顶点的社...
深度游走:一种社交
表示
的在线
学习
算法主要思想
Deep
walk
算法参考文献
Deep
walk
是一种将随机游走(random
walk
)和word2vec两种算法相结合的
图
结构数据挖掘算法。该算法能够
学习
网络的隐藏信息,能够将
图
中的节点
表示
为一个包含潜在信息的向量,如
图
1-2所示。
图
1 输入:
图
信号
图
2 输出:
图
节点嵌入
Deep
walk
算法
该算法主要分为...
wwwshengbo:
IDEA报错:不支持发行版本 | 不再支持源选项 5 请使用 6 或更高版本。
十里春风679:
什么是信噪比?信噪比越大好还是越小好?
什么是信噪比?信噪比越大好还是越小好?
高斯赛德尔迭代: