中国科学家团队开发基因组优化设计模型加速玉米杂交育种

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10月21日，《生物信息学简报》期刊在线发表中国农业大学王向峰团队与西北农林科技大学马闯团队的合作研究成果。杂交育种的本质是通过基因组片段的重组将染色体上的遗传变异（或称基因型、等位基因）重新排列组合，以获得育种家期望的目标性状。因此，育种家选择育种材料本质上是选择优良等位基因组合模式。

基于该原理，该研究提出了“基因组优化设计”的策略（GOVS），即通过算法模拟出一个理论上尽可能多地聚合了某个育种群体中目标表型的优势基因组片段或有利等位基因的虚拟基因组。

这个虚拟的最优基因组可以辅助育种家进行两个育种决策：第一，根据自交系对虚拟基因组贡献的优质基因组片段的个数进行选系，即提供优质片段越多的自交系，对目标性状贡献越大；第二，辅助育种家选择优势等位基因互补的自交系杂交，结合双单倍体诱导技术进一步聚合优势等位基因。

利用基因组优化设计模型，结合全基因组选择以及双单倍体诱导技术可以指导育种家利用最少的遗传材料、最短的育种周期，最大限度聚合优势等位基因。（来源：《生物信息学简报》期刊）