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Powershell有一个现成的可以匹配两个文本内容差异的工具Compare-object,方便快捷,

我们怎么使用它呢,举一个例子,有两个文件File1和File2,匹配一下两个文件的不同:

File1.txt:

File2.txt:

这是一个很小众的需求。大部分变异检测都是基于组装质量比较高的基因组,而不是那种初步拼接的contig。 由于初步拼接的参考序列通常会有成千上万个contig序列,也就导致在VCF的头文件的##contig=部分会有成千上万个contig,将这个文件加载到IGV时, IGV会去解析VCF,这将会是非常缓慢的过程,最好的策略就是只提取其中一个contig查看。