添加链接
link之家
链接快照平台
  • 输入网页链接,自动生成快照
  • 标签化管理网页链接

我有一个2D(二维) NumPy数组,并希望用255.0替换大于或等于阈值T的所有值。据我所知,最基础的方法是:

shape = arr.shape
result = np.zeros(shape)
for x in range(0, shape[0]):
    for y in range(0, shape[1]):
        if arr[x, y] >= T:
            result[x, y] = 255
  1. 有更简洁和pythonic的方式来做到这一点吗?

  2. 有没有更快(可能不那么简洁和/或不那么pythonic)的方式来做到这一点?

这将成为人体头部MRI扫描窗口/等级调整子程序的一部分,2D numpy数组是图像像素数据。

最佳解决思路

我认为最快和最简洁的方法是使用Numpy的内置索引。如果您有名为arrndarray,则可以按如下所示将所有元素>255替换为值x

arr[arr > 255] = x

我用500 x 500的随机矩阵在我的机器上运行了这个函数,用5替换了所有> 0.5的值,平均耗时7.59ms。

In [1]: import numpy as np
In [2]: A = np.random.rand(500, 500)
In [3]: timeit A[A > 0.5] = 5
100 loops, best of 3: 7.59 ms per loop

次佳解决思路

因为实际上需要一个不同的数组,arr,其中arr < 255,可以简单地完成:

result = np.minimum(arr, 255)

更一般地,对于下限和/或上限:

result = np.clip(arr, 0, 255)

如果只是想访问超过255的值,np.clipnp.minimum(或者np.maximum)对你的情况更好更快。

In [292]: timeit np.minimum(a, 255)
100000 loops, best of 3: 19.6 µs per loop
In [293]: %%timeit
   .....: c = np.copy(a)
   .....: c[a>255] = 255
   .....: 
10000 loops, best of 3: 86.6 µs per loop

如果要执行in-place(即修改arr而不是创建result),则可以使用np.minimumout参数:

np.minimum(arr, 255, out=arr)
np.clip(arr, 0, 255, arr)

(out=名称是可选的,因为参数的顺序与函数的定义相同。)

对于in-place修改,布尔索引加速了很多(不必分别修改和拷贝),但仍然不如minimum

In [328]: %%timeit
   .....: a = np.random.randint(0, 300, (100,100))
   .....: np.minimum(a, 255, a)
   .....: 
100000 loops, best of 3: 303 µs per loop
In [329]: %%timeit
   .....: a = np.random.randint(0, 300, (100,100))
   .....: a[a>255] = 255
   .....: 
100000 loops, best of 3: 356 µs per loop

比较来看,如果你想限制你的最大值和最小值,没有clip将不得不像下面这样做两次

np.minimum(a, 255, a)
np.maximum(a, 0, a)
a[a>255] = 255
a[a<0] = 0

第三种解决思路

可以通过使用where功能来达到最快的速度:

例如,在numpy数组中查找大于0.2的项目,并用0代替它们:

import numpy as np
nums = np.random.rand(4,3)
print np.where(nums > 0.2, 0, nums)

第四种思路

可以考虑使用numpy.putmask

np.putmask(arr, arr>=T, 255.0)

下面是与Numpy内置索引的性能比较:

In [1]: import numpy as np
In [2]: A = np.random.rand(500, 500)
In [3]: timeit np.putmask(A, A>0.5, 5)
1000 loops, best of 3: 1.34 ms per loop
In [4]: timeit A[A > 0.5] = 5
1000 loops, best of 3: 1.82 ms per loop
 

        转自https://vimsky.com/article/3727.html?_sm_nck=1

我有一个2D(二维) NumPy数组,并希望用255.0替换大于或等于阈值T的所有值。据我所知,最基础的方法是:shape = arr.shaperesult = np.zeros(shape)for x in range(0, shape[0]): for y in range(0, shape[1]): if arr[x, y] &amp;gt;= T: ... 1.1 Numpy的介绍 Numpy(Numerical Python)是一个开源的Python科学计算库,用于快速处理任意维度的组。 Numpy支持常见的组和矩阵操作。对于同样的计算任务,使用Numpy比直接使用Python要简洁的多。 Numpy使用ndarray对象来处理多维组,该对象是一个快速而灵活的大据容器。 1.2 ndarray介绍 Numpy提供了一个N维组类型ndarray,它描述了相同类型的“items”的集合。 import numpy as n. import numpy as np a = np.random.randint(-5, 5, (1, 10)) c=np.sum(a>=1) #条件为大于等于1 print ("随机组a : "+str(a)) #输出组a print ("大于等于1的个: "+str(c)) #输出满足条件的个 随机组a : [[-1 2 4 1 -1 -5 -5 2 2 4]] 大于等于1的个: 6
np.sort()函的作用,从小到大排序。(这里我也需要注意axis) 不写的话他的默认为1. 使用x == np.max(x) 获得一个掩模矩阵,然后使用where方法即可返回最大对应位置。 编程PCA算法的时候 x=np.array([[-1,-1,0,2,0], [-2,0,0,1,1]]) yuan=x x=0.2*np.dot(x,x.T) e,v=np.linalg.eig(x) print(v) re=np.where(e==np.max(e)) v=v.T[r
最近需要从热力图中找出关键点的坐标,也就是极大的行和列。搜寻了网上的一些方法,在这里总结一下。使用numpy进行多维数组中最大的行和列搜寻非常的灵活,有以下几种方法可供参考。 二维组 方法一:np.max()函 + np.where()函 如下图所示,x是一个 3×3 的二维np.array,首先使用np.max(x)求出x中的最大,然后使用np.where函找出组x中最大所在的位置。当然这只是np.where的其中一种用法,np.where是一个非常方便的函,用法还有很多,具体可
t_index = np.where(arr>2) print(t_index) #(array([0, 1, 1], dtype=int64), array([2, 1, 2], dtype=int64)) #表示坐标为(0,2)(1,1)(1,2)... NumPy组创建: np.empty(shape, dtype = float, order = 'C') #shape形状, dtype类型, order存储元素的顺序(一般不用指定这一项)。 np.zeros(shape, dtype = float, order = 'C') np.ones(shape, dtype = float, order = 'C') DEPRECATION: Python 2.7 will reach the end of its life on January 1st, 2020. Please upgrade 57476 解决E:Could not get lock /var/lib/apt/lists/lock - open (11: Resource temporarily unavailable) 35765