学校设有校长办公室、 政教处 、教务处、教研室、团委、 总务处 等机构。为了 强化管理 ，增强 竞争意识 ，1996年8月，学校实行了内部 管理体制 的改革，即 校长负责制 下的全员 聘任制 。聘任制的实行，调动了广大教职工的 工作积极性 ，实现了教育 教学质量 一年一大步，岁岁上台阶的计划，完成了睢县高级中学的振兴阶段和创办 豫东 名校的办学目标。1999年10月，在对原来改革方案进行修改、补充、完善的基础上，校教代会又通过了《睢县高级中学对学生实行德育量化管理的实施方案》，使学校的管理更加合理化、全面化、规范化、科学化。学校一贯坚持社会主义办学方向，坚持“诸育并重，德育为首”“以章治校”“严谨执教”三个原则。对教师提倡奉献精神、 拼搏精神 、“ 三苦 ”精神和团结协作精神，要求学生“规规矩矩做人，认认真真读书”。在校园建设中，学校努力改善办学条件，做好绿化、美化工作，校园面貌日新月异， 花园式学校 已初具规模。经过多年的努力，睢县高级中学形成了“团结、奋进、求实、创新”的校风，“严谨、科学、爱生、互助”的教风，“勤学、善思、尊师、守纪”的学风。全体教职工正朝着 学校管理 高层次、师资队伍高水平、育人环境高品位、设施建设高标准、 课堂教学 高效率、 全面发展 高质量的“六高”的目标，以崭新的姿态，昂扬的斗志争创国家级 示范性高中 。

总占地353亩， 总建筑面积 14万平方米的新校区2002年秋季已投入使用，根据学校的发展规划，将在五年内建成集高中、初中、小学及学前教育为一体的豫东教育集团，相信睢县高级中学的一定会更加灿烂辉煌。